湖南平江县思村人，又名金绍，1904年3月生于一户贫苦农家。他3岁丧父，因其母改嫁，由叔父收养。他9岁上学，两年后便辍学跟叔父学染布，16岁起到本县怡丰纸庄当挑夫。
当时的思村，楠竹漫山，纸槽林立。全乡250余只纸槽全归豪绅占有，近千名纸工靠出卖廉价劳力为生。为反抗槽户的剥削，1925年，辜家洞、徐家洞、灶门洞相继成立了纸工工会。邱金生成为纸工工会的骨干。
1926年春节过后，邱金生辞工回乡与邱训民等人开始组织秘密农会。同年7月的一天下午，邱金生在山坡上砍柴时，见一班北洋军阀溃兵卸下枪支在河里洗澡，便萌发了一个大胆的念头。他趁士兵们在水中玩得正欢，毫无戒备时，跑至河边，用扦担挑起8支步枪，飞快钻入丛林中。此事迹后被电影创作人员收集整理，编入电影《怒潮》中。
同年8月，北伐军攻克了平江县城，全县的农民运动进入高潮。邱金生等人立即在秘密农会基础上，成立了思村农民协会和农民自卫队，并担任了乡农协秘书和自卫队教官，负责训练自卫队员的工作。
1927年春，邱金生由罗纳川介绍加入了中国共产党，并担任平江县南九区特务队队长。他率领特务队配合邱训民带领的农民自卫队摧毁了思村挨户团，缴获9支长枪。同年7月，他又率队在与反动民团的遭遇战中，大获全胜，缴枪50余支。
通过几次战斗，邱金生率领的特务队很快发展到300余人、70余支枪，并奉命改编为游击队。
“马日事变”后，邱金生将游击队带到本县百福洞一带坚持武装斗争。1928年夏，他率队编入平江起义部队红五军第一纵队，并被任命为第三大队大队长。
1929年3月，在攻打于都县城的战斗中，邱金生率队抢当先锋，一天急行军百余华里，于黄昏前到达指定地点，即与当地赤卫队取得联系，摸清了敌情。
午夜，他率领100名敢死队员跳入河中，从敌人防守薄弱的地方攀墙上城，然后分3个小组分别摸入敌营房。熟睡的敌人来不及喊叫、抵抗，便在敢死队员的刺刀下丧命。旋即，邱金生命令点烧信号火堆，通知纵队攻城。经过两小时激战，守城敌人全部被歼，武器和给养物资也全被缴获。邱金生因战功显著，不久便被提升为第一纵队副纵队长。
1930年春，邱金生率纵队一部攻打宜丰县上富市。他指挥部队深夜袭击，歼敌200余名，缴获机枪4挺，其它枪支300多支。当时，纵队的同志都夸邱金生是夜战将军。
1931年春，湘鄂赣边区的地方革命武装奉命编为3个独立师，其中以万（载）、宜（丰）、萍（乡）及浏阳一部分地方武装为基础，成立了红军独立第二师，邱金生出任师长。在湘鄂赣苏区第二次反“围剿”战斗中，为了有效地牵制敌军，他与师政委徐洪奉命率领全师向浏阳与长沙交界的永安市出发，途中与敌军遭遇。激战半日，大败敌军，俘虏500余人。为避免沿途杂牌敌军的骚扰，邱金生命令部队改穿缴来的国民党军服，乔装“国军”，顺利通过了一道道敌哨卡，按时到达永安市郊，并连夜发起攻击，占领了永安市。当长沙敌军闻讯，急调回增援南昌的部队反攻永安市时，邱金生又率部返回湘赣边区，成功地完成了牵制敌军的任务。
是年10月，红十六军在万载的茵果附近受挫，独立二师奉命前往增援。邱金生率部走黄茅、芳林迂回至敌人左后侧，突然发起进攻，使围困红十六军之敌腹背受击，仓惶撤退。接着他又率部乘胜追击，歼敌300余人。其后，他指挥独立二师配合红十六军先后在修水、阳新、通山连克敌军，取得了五战五捷的胜利，使独立二师成为湘鄂赣边区的红军坚强主力之一。
同年底，邱金生率独立二师转入湘北向鄂东南游击，途中不幸遭到敌军的重兵进攻，情况十分危急。为了摆脱险境，邱金生与政委徐洪商议，兵分两路：一路引敌追赶，一路直捣敌指挥部，用“掏心战”将追敌调回，使敌首尾不能兼顾。依此计，徐洪率一路往嘉鱼、赤壁方向急行，敌主力随即追击；邱金生率一路埋伏于敌指挥部驻地马家洲附近的沼泽，于深夜发起攻击，猛捣敌指挥部。敌未料此着，急调追兵回扑。邱金生与徐洪乘敌乱成一团之际，全师急行军安全回师湘北，并先后攻占了距岳州60余里的中黄、桃州，缴枪200余支。
1932年5月，在铜鼓攻击战中，邱金生率独立二师协同独立一师截住了敌援兵一个团和两个营，并将其全部消灭。
1933年春，独立一、二师在万载高村合编为红十八军，邱金生任红十八军五十四师师长。3月19日，红军6个师在高村集中，决定进攻南昌。邱金生因长期野外作战，风餐露宿，患上严重的腿部关节炎。在往南昌开拔途中，已不能行走。经上级批准，他暂离队被安置在宜丰县一户农民家里休养。
1934年春，湘鄂赣苏区遭敌80余个团的进攻，红军损失甚大，省委驻地小源受到严重威胁。邱金生拖着未愈的病体临危受命，担任湘鄂赣军区第三作战分区暨赣北独立师司令员之职，领导浏（阳）、宜（丰）、万（载）独立团及地方游击队保卫根据地，牵制和袭击敌人，配合主力红军实行战略转移。
紧张、艰苦、恶劣的战争环境，使邱金生的关节炎于同年4月再度恶化起来，连日卧床不起，后又患了严重的疟疾，生命垂危。政委傅秋涛立即派警卫员护送他回平江治疗。
当时，湘鄂赣苏区已遭严重破坏。邱金生回到平江后，只好隐蔽在思村的豹岭山上。由于反动军队的严密封锁，医药、食品奇缺，其中一名警卫员经不住艰苦环境的考验，借下山求药之机，叛变投敌。次日，邱金生被安定挨户团队逮捕，旋即押至县城。在敌人严刑拷问下，邱金生始终威武不屈。敌人无可奈何，将他杀害于平江拥江三角塘。
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